Mais Héraclès ne se laissa pas distraire de sa mission, il écrasa le crabe et protégé par sa tunique en peau de lion il approcha l’hydre en retenant sa respiration. Muni d’une serpe en or il décapita la tête immortelle et l’enterra sous un gros rocher, puis il trempa ses flèches dans les entrailles empoisonnées de l’hydre, afin de les enduire du mortel venin.
Héra, furieuse de cette nouvelle victoire d'Héraclès récompensa le crabe pour sa tentative de diversion et l’introduisit dans les signes du Zodiaque, c’est le Cancer.
Quant à Eurysthée, il contesta le déroulement de l’épreuve. Considérant que Héraclès avait été aidé par Athéna et par Iolaos, il refusa l’exploit.
Il rajouta un nouveau travail aux dix travaux prévus initialement.